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問(wèn)答題
【簡(jiǎn)答題】什么是序列比對(duì)中使用的PAM矩陣和BLOSUM矩陣,它們的作用是什么,一般BLAST選擇使用的矩陣是什么
答案:
PAM矩陣和BLOSUM矩陣都是用于序列相似性的記分矩陣(scoring matrix)。記分矩陣中含有對(duì)齊時(shí)具體使用的...
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問(wèn)答題
【簡(jiǎn)答題】BLAST中,E值和P值分別是什么,它們有什么意義?
答案:
BLAST中使用的統(tǒng)計(jì)值有概率p值和期望e值。
E期望值(E-value)這個(gè)數(shù)值表示你僅僅因?yàn)殡S機(jī)性造成獲得...
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問(wèn)答題
【簡(jiǎn)答題】假設(shè)你得到一段未知蛋白的氨基酸序列,從你學(xué)習(xí)到的生物信息學(xué)分析方法和軟件,設(shè)計(jì)一個(gè)分析流程來(lái)分析該未知蛋白的功能和家族類別以及其結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。
答案:
1、用該序列進(jìn)行BLASTP搜索。
2、再對(duì)其進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、功能域的搜索,可以用Znterproscan、...
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