【簡答題】A單位于1980年8月經(jīng)批準(zhǔn)取得8500m²。土地建五層商業(yè)樓，后由于資金緊張，于次年3月與B單位簽訂協(xié)議，雙方約定由B單位出資共同建造，房屋建成后1～2層歸B單位使用，建筑面積16890m²，3～5層歸A單位使用，建筑面積25335m²。后雙方按協(xié)議分配并使用房屋至今，但一直未申請土地登記?，F(xiàn)B單位因企業(yè)改制，要求辦理土地登記，但A單位以自己是用地批準(zhǔn)文件的主體以及合建協(xié)議未約定土地為由，認(rèn)為該8500m²土地使用權(quán)應(yīng)當(dāng)歸屬自己。如果B單位委托土地登記代理機(jī)構(gòu)代理申請?jiān)撟诘赝恋氐怯洠摍C(jī)構(gòu)應(yīng)如何辦理？